藿香正气水由于具有解表化湿、理气和中的作用，所以，一般多用它治疗因外感风寒、内伤湿滞所导致的霍乱吐泻、发热恶寒、头痛身重、胸膈满闷及脘腹疼痛等症。其实，藿香正气水的功能远不止这些，它还有很多其他妙用！近年经过临床实践，发现藿香正气水对皮肤科疾病等也有显著的疗效。
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抑菌、抗病毒
藿香所含广藿香酮则对金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、甲型溶血性链球菌、肺炎双球菌，均有抑制作用。
厚朴有广泛抗菌作用，其抗菌成分较稳定，不易被热、酸、碱等所破坏，试验证明，其对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、痢疾杆菌等均抑制作用。
紫苏对大肠杆菌、痢疾杆菌、葡萄球菌等亦有抑制作用。
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现代医学认为皮肤癣、灰指甲是皮肤癣菌感染引起，而藿香、紫苏、白芷、桔梗分别对多种致病真菌有较强的抑制作用，故而在临床中治疗头癣、手足癣、灰指甲有较好的疗效。
可用藿香正气水涂擦患处，每日1-2次，有条件者每日多擦几次。5天为一疗程，一般1～2个疗程即可见效。
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疖
中医一般分为暑疖和多发性疖病，认为是内郁湿热、血热或外受风热暑邪而成，现代医学认为是葡萄球菌感染所致。
而藿香正气水中的紫苏等成分有抑制葡萄球菌的作用，此外藿香芳香化湿，白芷发表、祛风、胜湿，能散郁除湿，治疗疖及疖病。
可用棉签蘸藿香正气水一日多次涂擦患部。
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白癜风
中医认为白癜风是风湿两邪侵入毛孔，以致气血瘀滞、毛窍闭塞而成。而藿香正气水有芳香通窍、促使气行的作用。气归血帅，气行则血行，血行则瘀散。
每日用净布蘸藿香正气水涂擦患部，微微用力，反复蘸擦至皮肤微红为度，一日2次。
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外阴瘙痒
因藿香正气水是由抗多种致病菌和杀滴虫的藿香、紫苏、白芷、生姜等药组成，故治疗外阴痞痒有较好的疗效。
以藿香正气水兑50倍凉开水稀释后清洗外阴，男女皆可用。不但有止痒疗效，而且有一种清爽感。
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外痔
先将患处洗净，每次用藿香正气水20毫升加凉开水1000毫升，以药棉擦洗，每日2次。在炎症期发作时有消炎止痛、促使萎缩之作用。
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可治疗肛门湿疹
在每晚临睡前，先将患处洗净，再用棉签蘸取藿香正气水涂搽患处，2周为一个疗程。此法具有良好的燥湿止痒之效。
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晕车晕船
可用医用棉签蘸取藿香正气水，直接外涂肚脐，或将药液敷于肚脐内，有一定的预防作用。
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蚊虫叮咬
用适量的藿香正气水外搽患部3—5分钟，很快就能消除瘙痒。
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湿疹和汗疹
用藿香正气水外涂皮损处，每天3—5次，连用3—5日。
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皮肤瘙痒
用藿香正气水直接涂于患处，1日3—5次。
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治小儿痱子
用藿香正气水治疗小儿痱子，效果较好。
可取藿香正气水1支，按比例加凉开水或生理盐水稀释，稀释浓度为：不满3个月者，药液与水比例为1:3；4～12个月者，药液与水比例为1:2；超过1岁者，药液与水比例为1:1。
用药之前先用温水将局部洗净擦干，然后用消毒药棉蘸稀释后的药液涂擦患处，每日2～3次。
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腹泻
取干净纱布一块，折叠成4～6层置于肚脐处，将藿香正气水置温水中预热，待药温适宜时倒在纱布上，以充盈不溢为度，用塑料布覆盖纱布后，再用医用胶布固定，2～3小时后取下，每日2～3次，一般2日即可见效。严重者应及时就医。
1、藿香正气水采用酒精作为溶媒，其酒精含量常高达40%到50%，所以某些对酒精比较敏感的病人服用藿香正气水后有可能出现醉酒的表现。
2、驾车出行或正处于室外高危险工作（如：高空作业）者，不宜服用藿香正气水。
3、服用藿香正气水后至少半小时再驾车，并多张口呼吸，尽快使乙醇挥发。
