从2009年医改启动以来，各级财政努力调整支出结构，不断加大投入力度，政府卫生投入实现了跨越式增长。根据财政决算数据，2009年到2015年全国各级财政医疗卫生累计支出达到56400多亿元，年均增幅达到20.8%，比同期全国财政支出增幅高4.8个百分点，医疗卫生支出占财政支出的比重从医改前2008年的5.1%提高到2015年的6.8%。
其中，中央财政医疗卫生累计支出达到15700多亿元，年均增幅达到21.9%，比同期中央财政支出增幅高9.8个百分点，医疗卫生支出占中央财政支出的比重从2008年的的2.35%提高到2015年的4.23%。
2016年全国财政一般公共预算收入仅增长3%。尽管如此，各级财政继续将医疗卫生作为财政支持的重点领域，加大投入力度。全国财政医疗卫生支出预算安排12363亿元，比2015年增长3.7%，比同期全国财政支出预算增幅高1.3个百分点。其中，中央财政医疗卫生支出预算安排3731亿元，比2015年增长9.3%，比同期中央财政支出预算增幅高3个百分点。
2016年政府卫生投入重点用于支持五个方面的改革
一、支持健全全民医保体系
2016年各级财政对新农合和城镇居民医保的补助标准从2015年的每人每年380元提高到420元，新增筹资主要用于提高基本医疗保障水平，并加大对城乡居民大病保险的支持力度。
二、支持促进基本公共卫生服务均等化
2016年，人均基本公共卫生服务经费标准从2015年的每人每年40元提高到45元。
三、支持公立医院改革
2016年，县级公立医院改革全面深化，城市公立医院改革扩大到200个城市，中央财政对县级公立医院改革每县每年补助300万元，对试点城市每个城市一次性补助2000万元，对试点城市的市辖区每区每年补助100万元。
四、支持健全基层医疗卫生服务体系
五、支持实施国家基本药物制度
中央财政继续安排补助资金支持基层医疗卫生机构实施基本药物制度，同时建立健全基层医疗卫生机构稳定长效的多渠道补偿机制。
据财政部数据，1-8月公共财政支出同比增长12.7%。同期，在医疗卫生和计划生育（医疗卫生）方面的公共财政支出达到8787亿元人民币，同比增长19.8%，占公共财政支出的比例达到7.6%。同时，医疗卫生方面的公共财政支出增速比教育的支出增速高8.1个百分点。相对高的医疗卫生公共财政支出增速将会使医药行业得益。
附：医疗卫生和计划生育公共财政支出变化（同比%）
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