今天给大家填充了一下叶老师提供的复习提纲,没时间复习的同学可以参考一下哦!这份提纲的了解部分我没有写进啦,因为需要了解的东西太多了,而考点又不明确,因此这部分不作为重点,没时间同学可以直接忽略掉。有一些部分的内容很重要,但是总结完之后又不够详细,因此我标明了页码,同学们可以参照书本复习。最后祝大家,取得好成绩!需要word版的可以私聊我。
第一章 绪论
了解发酵的概念。
了解发酵工程和现代生物技术发展的历史。
了解发酵工程的生物学与工程学基础。
第二章 菌种来源与种子培养
几种发酵生产重要化合物的菌种
抗生素生产:链霉菌
产氨基酸:黄色短杆菌、大肠杆菌、枯草芽孢杆菌
发酵工业对菌种的要求:能利用廉价原料、产量高、易改造、遗传稳定、不易染菌、安全、发酵工艺可行
氨基酸生产菌的要求:代谢途径简单、清楚
与酶制剂生产有关的微生物:一般来源于天然微生物的反复诱变和筛选。
食品领域用酶的生产菌:安全
药品领域用酶的生产菌:安全、无热源
用于外源蛋白生产的微生物:生长速度快、表达产量高、纯化方式简单、产物活性高、翻译后修饰正确、无热源
了解菌种筛选的流程。
采样→预处理→培养→菌落筛选→产物鉴定
其中预处理→培养→菌落筛选过程为富集阶段
富集的目的:让目的微生物在种群中占优势。
富集的方法:物理富集、定向培养、分类学考虑、随机分离。
来源:一般是土壤,其它如烟叶、温泉、海水、粪便等。
目的:获得高产目的产物的微生物
问题:如何提高获得高产目的产物的微生物的可能性
菌种选育的目的和要求。
目的:1)防止菌种退化;2)提高生产能力;3)改进产品质量;4)开发新产品
要求:菌种分布广泛、代谢能力强、生长迅速繁殖快、适应性强,容易培养、易发生变异
菌种退化的原因、防止菌种退化的措施。
菌种退化是指菌体在多次传代过程中发酵力、繁殖力或发酵产物得率逐渐降低的现象(回复突变)。
退化原因:培养条件不妥、菌种保藏不当、菌种不“纯”
菌种的复壮措施:
①纯种分离:(平板划线法、涂布法、倾注法、单细胞挑取法等)。
②通过寄主体内生长进行复壮(如Bacillus thuringiensis的复壮);
③淘汰已衰退的个体(采用比较激烈的理化条件进行处理,以杀死生命力较差的已衰退个体)。
④采用有效的菌种保藏方法。
防止菌种衰退的方法:
1)控制传代次数
2)选择合适的培养条件;
3)采用不同类型的细胞进行传代(对丝状微生物而言,通常采用稳定的单核孢子进行接种)
4)采用有效的菌种保藏方法
了解种子的扩大培养的概念。
概念:将保存在砂土管、冷冻干燥管中处于休眠状态的生产菌种接种至试管斜面活化后,再经过扁瓶或摇瓶及种子罐逐级扩大培养,最终获得一定数量和数量纯种的过程。
种子扩大培养的目的和要求
目的:接种量的需要、菌种的驯化、缩短发酵时间,保证生产水平
要求:总量及浓度满足工艺要求、生理状态稳定、生长旺盛、活力强、无杂菌污染
如何根据菌种特点选择培养物
培养物的选择,根据菌种特点分为两类:
不产孢子和芽孢:获得菌体。如谷氨酸棒杆菌
产孢子:1)孢子萌发快,菌丝难控制:获得孢子。如青霉素生产菌株。
2)菌丝易控制,孢子萌发慢:获得菌丝体。如大部分放线菌(链霉素、红霉素、卡那霉素)
实验室阶段培养基的选择
培养基的选择应该是有利于菌体的生长,或有利于孢子的生长。
在原料方面,规模小,保证质量,原料一般比较精细
生产车间阶段培养基的选择
培养基的选择依然是有利于菌体的生长,或有利于孢子的生长。
在原料方面原料一般比较粗糙,廉价易得
传代:
获得菌体:保藏斜面→活化斜面
获得孢子:保藏斜面→母斜面→子斜面
种龄、接种量的概念和要求。
种龄:种子在种子罐中培养的时间。
种龄太小:前期生长缓慢,发酵周期延长,产物形成推迟,有时可能导致发酵异常。
种龄太大:活力低,生产能力下降。
一般选择对数生长期后期:活力高,代谢旺盛。
种龄不仅仅是一个时间概念,它反映了微生物所处的生理状态,是种子浓度、pH、种子形态、代谢产物浓度等的一个综合指标
接种量:接入的种子体积占接种后培养液体积的百分比。
接种量取决于微生物的生长速度。接种量大可缩短发酵时间,减少染菌机会,但可造成溶氧不足,影响产物合成。具体的接种量需要通过反复试验来确定。
发酵级数多少的依据。
种子罐的级数:生产车间阶段制备种子需要逐级扩大培养的次数。
发酵级数:菌体从液体培养种子到发酵逐级扩大经过的次数。
例子:谷氨酸发酵:如果一级种子为摇瓶,二级种子为种子罐,则种子罐的级数为一级。发酵级数包括一级种子、二级种子和发酵罐,即发酵级数为三级。
发酵级数确定的依据
级数受发酵规模、菌体生长特性和接种量的影响。
级数大:易染菌、易变异、难管理、难控制。
级数小:简化工艺、节约成本、减少染菌、易于控制。
生长快的菌种,如细菌:种子用量较少,需要的级数少。
生长慢的菌种,如放线菌:接种量大,需要的级数多。
第三章 发酵培养基与灭菌
广义上讲,培养基(medium)是指一切可供生物细胞生长繁殖所需的一组营养物质和原料。
常用培养基需要符合以下条件:
提供细胞组成的原料
提供生化反应的条件
用于生产的培养基还要利于产物的合成。
培养基中特定组成的预处理
内容很杂说不清楚,可以参考书本P39-42
前体
某些化合物加入到发酵培养基中,自身结构(或部分结构)能直接被微生物合成到产物分子中去,从而显著提高产物的产量。
前体一般有毒性,浓度过大不利于菌体生长。基础料中苯乙酸的添加量一般为0.07%。前体一般价格高,添加多了易挥发或氧化。流加有利于提高前体的转化率。
培养基设计的原则
(1)细胞同化能力。许多碳源和氮源都是复杂的有机物大分子,用这类原料作为培养基,微生物必须具备分泌胞外淀粉酶和蛋白酶的能力。
(2)代谢的阻遏和诱导。
(3)合适的碳氮比,一般为100:0.2-100:2。产物含氮量高的,N源比例要升高。如谷氨酸发酵,100:15-100:21
(4)合适的pH,一般不直接用酸碱来调节
(这部分内容很多而且最好详细地掌握,因此详见:P47-50)
转化率和实际转化率
实际转化率:菌体生长和维持需要消耗一定量的基质,因此实际转化率低于转化率
了解培养基优化的常用方法
培养基设计:
(1)根据前人的经验和培养基成分确定时一些必须考虑的问题,初步确定可能的培养基成分。
(2)通过单因子实验最终确定出最为适宜的培养基成分
(3)当培养基成分确定后,剩下的问题就是各成分最适的浓度,由于培养基成分很多,为减少实验次数常采用一些合理的实验设计方法
正交实验法
定义:用正交表安排多因素试验与分析试验结果的办法,简称正交试验。
因素:影响试验指标的条件
水平:因素所处的状态
湿热灭菌原理
湿热灭菌法是指用饱和水蒸气、沸水或流通蒸汽进行灭菌的方法,以高温高压水蒸气为介质,由于蒸汽潜热大,穿透力强,容易使蛋白质变性或凝固,最终导致微生物的死亡,所以该法的灭菌效率比干热灭菌法高。
对数残留定律和灭菌时间的计算
N为菌体数量,N0指开始灭菌时的菌体数量,Nt是指t时刻的菌体数量
第四章 发酵过程的基本工艺控制
发酵过程的种类
(1)分批培养
接种以后,除了空气的通入和排出,没有物料的加入和取出。整个过程中菌的浓度、营养成分的浓度和产物浓度等参数都随时间变化。
分批的优缺点
优点:操作简单,周期短,染菌机会少,生产过程和产品质量容易掌握。
缺点:产率低,不适于测定动力学数据
(2)补料分批培养
在分批培养过程中补料,以克服营养不足而导致发酵过早结束的缺点。只有料液的加入,没有料液的取出。所以发酵结束时发酵液的体积比发酵开始时有所增加。在很多工厂的实际生产中采用这种方法。
优点:可维持低的基质浓度,避免快速利用碳源的阻遏效应。通过补料,可以达到和稳定最佳的生长和产物合成条件。可以实现计算机自动控制。
缺点:无物料取出,产物的积累最终导致生产速率的下降。有物料加入,增加染菌的机会。
(3)半连续培养
在补料分批培养的基础上间歇地放掉部分发酵液(工业上称为带放)。如四环素发酵。
优点:放掉部分发酵液,再补入部分料液,使代谢有害物质得到稀释,有利于产物合成,提高了总产量。
缺点:代谢产生的前体物被稀释,提取的总体积增大。
(4)连续培养
发酵过程中一边补入新鲜料液一边放出等量的发酵液,使发酵罐内的体积维持恒定。达到稳态后,菌体的浓度、产物浓度和限制性基质的浓度都是恒定的
优点:控制稀释速率可以使发酵过程最优化。发酵周期长,产量高。μ = D,较易研究微生物的生长动力学。
缺点:如果菌种不稳定,长期连续培养会引起菌种退化,降低产量。长时间补料使染菌机会大大增加。
物理参数、化学参数和生物参数
物理参数:温度、搅拌转速、空气压力、空气流量、溶解氧、表观粘度、排气量(二氧化碳)浓度等。
化学参数:基质浓度(糖、氮、磷等)、pH、产物浓度、核算量等。
生物参数:菌丝形态、菌体浓度、比生长速率、呼吸强度、基质消耗速率、关键酶活力等。
呼吸商的定义的意义
氧消耗速率(OUR)表示单位体积发酵液在单位时间内利用的氧的量。
二氧化碳排出速率(CER)表示单位体积发酵液在单位时间内释放的二氧化碳的量。
呼吸商(RQ)=CER/OUR
RQ反映了氧的利用状况。葡萄糖基质在代谢中彻底被氧化,RQ=1;生成中间代谢物或用于菌体生长时,RQ<1;厌氧发酵时,RQ>1
发酵前期细胞合成需要较多能量,氧化较彻底,RQ较高;在发酵中后期,细胞利用体内已合成的酶系合成次级代谢产物,消耗能量较少,RQ会降低。
在发酵后期进行补料(补糖),OUR和CER都上升,且RQ会升高约10%:糖代谢加快,呼吸活动增强,产能增加
氨基氮和氨氮
氨基氮指有机氮中的氮(NH2-N),单位是mg/100mL
氨氮指无机氨中的氮(NH3-N)。
通过氮利用的快慢可以分析出菌体生长和含氮产物的合成情况:发酵前期,菌体大量生长,氮源代谢快;发酵中后期,菌体生长慢,如果产物不含氮或氮含量低,则氮的消耗会很少。通过NH2-N和NH3-N分析可控制发酵过程,适时补氮。发酵后期氨基氮回升是菌体细胞衰老自溶的迹象,可能是方罐点,否则可能影响下游提取。
分批发酵的缺点
缺点:产率低,不适于测定动力学数据
补料的意义和优缺点
意义:
(1)有利菌体的高密度培养或比生长速率控制。
(2)降低培养基中有毒底物对菌体生长的抑制。
(3)解除高浓度营养物和分解代谢物引起的阻遏作用。
(4)有利于适应发酵过程中的供氧要求。
(5)维持有利的发酵环境。如pH、黏度、氧传递系数等。
优点:推迟菌体自溶期,延长产物分泌期,维持较高的生产速率,增加发酵液总体积,使产量大幅度上升。现在大多数抗生素都采取补糖措施。
缺点:补料使工艺复杂化,而且增加了染菌机
补料方式
连续流加
少量多次
大量少次
发酵终点的判断标准
生产速率(g/L·h):表示单位时间合成的产物量。
随着发酵的进行生产率由上升到平缓,最后下降。生产速率下降明显表示菌体衰老,应结束发酵。
基质接近消耗完
主要看发酵液中残留的糖和氮。二者残留越少,对下游提取和成本控制有利。在放罐之前停止补料,就是为了能将基质消耗殆尽。
产物浓度(g/L)
产物浓度达到最高时结束发酵。有时难以控制最高点,则可以在最高点附近结束发酵。
氨基氮和pH
氨基氮和pH回升,则必须放罐。
pH变化的原因有哪些
糖代谢:特别是快速利用的糖,分解成小分子酸、醇,使pH下降。糖缺乏,则pH上升,是补料的标志之一。
氮代谢:当氨基酸中的NH2被利用,pH会下降;尿素被分解成NH3,pH上升,NH3被利用,pH又下降。碳源不足时,氮源被当做碳源利用,pH上升。
生理酸碱性物质利用:pH上升或下降
生成有机酸:pH下降。如衣康酸、柠檬酸等。
生成碱性产物:pH上升。如红霉素、洁霉素、螺旋霉素等
菌体自溶:pH上升
控制pH的方法有哪些
(1)调节好基础料的pH
基础料中若含有玉米浆,pH呈酸性,必须调节pH。若要控制消后pH在6.0,消前pH往往要调到6.5-6.8.
(2)在基础料中加入维持pH的物质
如CaCO3,或具有缓冲能力的试剂,如磷酸缓冲液等。
(3)通过补料调节pH
如调节补糖速率或空气流量来调节pH。
氨基氮低,pH低时补氨水;氨基氮低,pH高时补硫酸铵。
(4)当补料与调pH发生矛盾时,加酸碱调pH
pH的变化会对发酵造成什么样的影响
(1)pH影响酶的活性。
(2)pH影响细胞通透性。
(3)pH影响培养基某些成分和中间代谢物的解离,从而影响微生物对这些物质的利用。
(4)pH影响代谢方向。如黑曲霉在pH 2.0-3.0时产柠檬酸,在pH近中性时产草酸。
(5)pH在不同发酵阶段造成不同的影响。如巴斯德毕赤酵母生长时控制pH 5.0-5.5;产酶时控制pH 3.0-4.0
发酵温度的选择
(1)根据菌种及发酵阶段选择
发酵前期菌体量少,目的是尽快得到大量的菌体,可以选择稍高的温度。
发酵中期得到合成产物的合适的菌体量,需要延长合成的时间,需要稍微降低温度。
发酵后期产物合成能力下降,不需要延长发酵周期,可以再提高温度,刺激产物合成到放罐。
(2)根据培养条件选择。
如通气条件差时可适当降低温度,使菌种呼吸速率降低,以提高溶氧。培养基稀薄时,也可降低温度,降低营养利用速率,避免菌体过早自溶。
(3)根据微生物生长情况选择。
生长快,维持较高温度的时间要短些。营养丰富,通气能满足,可稍微提高温度
发酵热的概念
发酵热是引起发酵过程温度变化的原因。
发酵热就是发酵过程中释放出来的净热量。在发酵过程中微生物分解基质产生热量,机械搅拌产生热量,而罐壁散热、水分蒸发和空气排出则带走热量。这些热量的代数和称为净热量。
生物热(Q生物)
微生物在发酵过程中将营养物质分解氧化而产生的能量,其中一部分用于合成高能化合物,其余部分以热的形式散发出来。散发出来的这部分热称为生物热。
生物热与发酵的类型有关。好氧发酵的生物热大于厌氧发酵的生物热。
搅拌热(Q搅拌)
在机械搅拌发酵罐中,机械搅拌带动发酵液作机械运动,造成液体之间、液体与搅拌器等设备之间的摩擦而产生可观的热量。
搅拌热与搅拌功率有关
蒸发热(Q蒸发)
水分蒸发带走的热量。排气带走的热量为显热(Q显热),很小, Q显热一般可以忽略不计。
辐射热(Q蒸发)
发酵罐罐体想歪辐射的热量,取决于罐温与环境的温差,冬天大于夏天,一般不超过发酵热的5%。
泡沫的危害
降低生产能力
为防止起泡溢出而降低装液量,致使生产能力下降。
引起原料浪费
装液量过大,泡沫溢出会引起原料流失。
影响微生物呼吸
泡沫如果不破碎,随着发酵进行,其中会充满二氧化碳,且不能与空气中的氧交换,会影响微生物的呼吸
引起染菌
泡沫增多会排气管逃液,然杂菌。杂菌进入罐体会造成发酵液染菌。大量泡沫可由灌顶渗到轴封,轴封处落下的泡沫也往往引起染菌。
染菌的原因和染菌情况分析
染菌原因:种子染菌、设备穿孔、阀门渗漏、空气系统有菌、管理不善、其他原因
情况分析:
单罐染菌:不是系统问题,而是该罐本身的问题。
多罐染菌:系统问题,如空气过滤系统,移种或补料的分配站有渗漏或灭菌不彻底。
前期染菌:种子染菌、培养基灭菌不彻底。
中后期染菌:补料的料液灭菌不彻底或补料管道、阀门渗漏,一般不会是种子问题。
防止染菌的措施:
防止种子带菌
防止设备渗漏
防止培养基灭菌不彻底
防止空气引起的染菌
防止移种管道灭菌不彻底
染菌后采取适当的措施,避免再次染菌
第五章 好氧与厌氧发酵
溶解氧的定义。(DO, CL)
溶氧(DO):溶解的氧
溶氧浓度(CL):发酵液中的溶解氧浓度,单位:mmol/L
比耗氧速率或呼吸强度
单位时间内单位重量细胞所消耗的氧气量,单位:mmol/(g•h)。
摄氧率
单位时间内单位体积的发酵液所需的氧气量,单位: mmol/(L•h)
临界溶氧浓度的定义及其意义
定义:不影响微生物呼吸所允许的最低溶氧浓度,单位:mmol/L
意义:微生物对发酵液中溶解氧浓度的最低要求
氧饱和度
发酵液中的溶氧浓度与临界溶氧浓度的比值
氧传递速率
在气液传质过程中,氧传递速率为:
OTR—氧传递速率,mol/(m3·s)
P*--与液相中氧浓度C相平衡时氧的分压,Pa
C*--与气相中氧分压P相平衡时氧的浓度,mol/m3
KG--以氧分压差为总推动力的总传质系数,mol/(m2·s·Pa)
KL--以氧浓度差为总推动力的总传质系数,m/s
a—比表面积,m-1
体积溶氧系数或体积氧传递系数(KLa)
通常将KLa作为一项处理,称为体积溶氧系数或体积氧传递系数,单位为s-1或h-1
溶氧、氧传递和氧摄取的关系
第六章 发酵动力学与反应器基础
l 了解黑箱模型
在对细胞内的代谢途径不了解,或了解很少时,认为细胞的代谢是在“黑箱”中进行。
一般来说,“黑箱模型”不需要任何生化反应的数据,只需要测定底物和产物的输入和输出,计算消耗和生产的速度即可。
l 稀释速度(D)
或称空间速度(spacevelocity ),是保持时间的倒数。v为液体流入速度,V为发酵罐工作体积。
l 稳态连续模式及实现稳态的策略。
模式:连续搅拌罐式反应器Continuous, Stirred Tank Reactor, CSTR
液体输入速度v(L/h)、气体输入速度vg(L/h)、培养基体积V(L)和底物浓度与时间无关,即系统的所有输入参数都是稳定值,则我们认为所有的输出参数,包括生物量、细胞活性、代谢产物浓度也都是稳定值。
策略:
连续测定反应器中培养基体积或重量,控制液体输入速度v,直至设定值V。通过这种方法实现稳态,称为恒化培养(chemostat)。
对于恒浊培养(turbidostat)来说,通过测定输出液体中生物量的浓度x(g/L)来维持稳态。设定值是x。
通过控制营养物质,如葡萄糖的输入,并通过酸碱补料中和质子,也可以控制生化反应的速度,这种方法称为pH-auxostat。
通过测定流出液体中某些特定代谢产物的浓度来控制稀释速度,称为productostat。
l 得率系数、速率和比速率的定义及计算。
得率系数:物质i相对于物质j的得率。
l 得率系数的换算。
l C-mol的概念,C-mol生物量的计算。
l 莫诺德模型。
以微生物对葡萄糖的利用为例,己糖激酶催化葡萄糖磷酸化的反应,服从米氏方程:
微生物利用葡萄糖,则可以把酶反应速度看作是基质消耗速度v,可以把Km看作是Ks,得到:
l 分批发酵不同阶段的生长动力学。
稳定期:不生长或生长率与死亡率相等。
衰亡期:不生长或生长率与死亡率相等。
假定整个生长阶段无抑制物作用存在,则微生物生长动力学可用阶段函数表示如下:
l 分批发酵基质消耗速率与生长、合成关系
l 对数方程和莫诺德方程的区别。
用对数方程可以定量地预测微生物分批生长的生长曲线形状
对数方程在测定Ks和μmax时效果不佳。
l 维持和维持常数。
维持:
指活细胞群体在没有实质性的生长(生长和死亡处于动态平衡)和没有胞外代谢产物合成情况下的生命活动(如细胞的运动、细胞内外各种物质的交换、细胞物质的转运和更新等)。
维持常数:
单位质量干菌体在单位时间内因维持代谢消耗的基质量。
m越小,则菌体的能量代谢效率越高。
l 单级连续发酵的稳态方程。
对细胞(生物量)而言,其物料平衡可以表示为:
[积累的细胞]=[流入的细胞]-[流出的细胞]+[生长的细胞]+[死亡的细胞]
其中Xf和X分别为流入和流出反应器的细胞浓度,g/L;v为液体流入和流出的速度L/h,V为反应器内液体体积,L,μ和分别为比生长速率和比死亡速率,h-1。
推导可得:μ=D
对限制性基质而言,其物料平衡可以表示为:
[积累的基质]=[流入的基质]-[流出的基质]-[生长消耗的基质]-[维持生命需要的基质]-[形成产物消耗的基质]
其中Sf和S分别为流入和流出反应器的限制性基质浓度,g/L;YX/S为细胞生长的得率系数;qp为产物形成的比速率,g/(g·h);Ms为维持系数,mmol/(mg·h);YP/S为基质形成产物的产物得率系数;v为液体流入和流出的速度L/h,V为反应器内液体体积,L,μ和分别为比生长速率和比死亡速率,h-1。
推到可得:
l 洗脱。
l 最适稀释度。
l 细胞生产率PX
l 分批培养和连续培养的选择依据。
第七章 发酵过程优化与多尺度参数相关分析
掌握理化相关和生物相关
(1)理化相关:纯属物质理化性质变化所引起的参数相关
1)物理过程:物质或能量传递、混和、平衡或不平衡
传热(加热或冷却):温度
发酵过程中打开冷却水的阀门引起罐温的下降。
2)化学过程:发生某些化学反应的结果。
加入某种酸碱物质引起的pH的变化
3)搅拌转速与溶解氧的相关性:搅拌越剧烈气泡越多气液接触面积越大体积溶氧系数越大
4)加油消泡引起的参数相关:加油消泡二氧化碳释放量增加
(2)生物相关。生物相关是指通过生物细胞的生命活动所引起的参数之间耦合相关
1)菌体生长引起的生物相关:
快速生长期时,培养液粘度上升,KLa下降,引起DO水平的变化。
菌体生长时,OUR与CER发生变化。但由于OUR与所利用的碳源的还原度有关,以及与菌体代谢途经密切相关,而CER主要涉及到碳平衡,所以一般宜以CER与菌体生长相关。
氮源在菌体代谢过程中不能作为能源供应,因此氮源的变化一般与菌体的维持无关,但菌体生长时,必需由氮源提供生长所需N元素材料。
2)代谢引起的生物相关
通过生物细胞及代谢途径的不同所引起的活性变化,直接对控制对象特性发生影响。
菌体细胞代谢活性变化(环境条件的线性或动力学因素、细胞内某调节因子引起的代谢流迁移、基因尺度的信息流)而直接引起的某测定参数的变化,即为代谢特性参数相关,如:
*代谢强度的变化
*代谢途径的变化
*引起的基质消耗或代谢产物形成的不同
理解多尺度参数之间的相关分析。
第十一章 异源蛋白的表达和发酵
异源蛋白表达宿主的要求
药用蛋白仅限于几种表达系统:E.coli、几种酵母和哺乳动物细胞。
食品:GRAS(generally recognized as safe)菌种
大肠杆菌:
表达形式:融合蛋白、分泌蛋白(周质空间或胞外)和包涵体。
缺点:无翻译后修饰(糖基化、脂肪酸酯化、磷酸化、二硫键)、保留甲硫氨酸、错误折叠、有内毒素、有蛋白酶、有密码子偏好
优点:GRAS,低成本、简单、快速、表达量高。
枯草芽孢杆菌
缺点:有蛋白酶、质粒不稳定。
优点:GRAS,不分泌内毒素、可用噬菌体转化、分泌表达、高密度、无密码子偏好
自相关和反相关。
自相关模式(autocorrelated pattern),同一氨基酸倾向于使用相同的密码子;
反相关模式(anticorrelated pattern),同一氨基酸倾向于使用不同的密码子
了解异源蛋白表达和发酵的流程。
第十二章 发酵工程、合成生物学和系统生物学
了解系统生物学和合成生物学的概念。
了解系统生物学、合成生物学和发酵工程结合的发展趋势。