卢煜明教授
被誉为“NIPT之父”、来自香港中文大学的卢煜明教授所带领的研究团队开发了NIPT在单基因遗传病检测的新应用——无需已知单基因遗传病家族史即可进行无创产前单基因遗传病的检测。对父母双方基因组单倍型分型，并对单基因病突变位点附近有效SNP进行区分；通过对母亲外周血DNA进行测序，并应用Relative Haplotype Dosage (RHDO) 分析法推断胎儿是否存在相关遗传突变。
前段时间，香港中文大学卢煜明教授曾在PNAS杂志上发布了第二代无创胎儿基因组分析结果。研究人员通过对母体血浆DNA进行全基因组测序（195×和270×单倍体基因组覆盖），经过一系列生物信息学筛选，成功检测到了胎儿新发突变。此次，卢煜明教授研究团队利用10X Genomics的Linked Read技术和Illumina的测序技术，对父母双方基因组单倍型分型，之后应用母亲外周血DNA分析胎儿是否存在单基因遗传病突变。
胎儿基因组可以分为2部分，一部分遗传自父亲，一部分遗传自母亲。RHDO分析法的原理为，母本DNA以成对染色体形式存在，母本DNA中来自母本父亲DNA与来自母本母亲DNA的比例为1:1。而胎儿DNA会释放一些母本DNA到母亲的血浆中，那么最终将导致原来的1:1失去平衡。2010年，卢煜明教授研究团队正是利用这个原理通过统计算法，开发了Relative Haplotype Dosage (RHDO) 方法来分析胎儿基因组，但该方法在父母基因组单倍型分型方面仍存在缺陷。
10X Genomics公司通过在序列中引入barcode序列，制备出了一种特殊的文库，通过利用Illumina的二代测序，能够得出了跨度在30-100kb的linked reads信息。linked reads使结构变异的检测更加容易。例如，在基因组测序研究中，利用10X Genomics的linked reads技术能检测到一些拷贝数变异，但如果只利用Hiseq全基因组测序数据是无法被发现的。另外，linked reads数据能够鉴别出标准测序数据完全无法鉴定的一个串联重复。
研究人员表示，下一步计划招募上百位志愿者进行临床试验阶段。该项技术的适用人群非常广泛，主要分为以下三类：（1）有单基因遗传病家族史的人群，希望通过无创的方式了解他们的胎儿是否存在相关突变；（2）没有单基因遗传病家族史但为携带者的人群；（3）胎儿超声异常提示可能为某种单基因遗传病所导致的人群。
无创单基因遗传病检测大多数都处在实验室研发阶段，并没有大规模的临床试验验证。目前有针对先天性肾上腺皮质增生、枫糖尿病、地贫等疾病的研究。2014年，《Genetics in Medicine》和《Gene》上的研究结合靶向测序和NIPT技术，分别开发了检测胎儿枫糖尿病基因型和先天性肾上腺皮质增生基因型的方法。
人物
简介
卢煜明（LO Yuk Ming Dennis），分子生物学临床应用专家，尤其致力于研究人体内血浆的DNA和RNA。现为香港中文大学李嘉诚健康科学研究所所长、李嘉诚医学讲座教授兼化学病理学讲座教授 。重药贝瑞股东之一北京贝瑞和康生物技术股份有限公司在香港地区与卢煜明教授开展合作，成立香港雅士能基因科技有限公司（Xcelom），凭借香港中文大学的专利授权为香港和周边地区提供更有保障的基因检测服务。
