整体来看，榜单相较于2015年变化不大。扬子江药业集团有限公司、广州医药集团股份有限公司、修正药业集团股份有限公司连续三年位列前三甲。
作为医药行业的领军力量，百强企业代表着中国医药工业发展的最高水平。自2014年以来，目前十强企业已趋于稳定，行业龙头格局显现。2016年百强企业格局整体变化幅度不大。17家企业排名不变，39家企业的排名同比上扬，也有39家企业的排名有不同程度的同比下降。
中国医药工业百强企业的入围门槛从2010年的14亿元逐渐提升至2015年的23亿元，2016年门槛突破了24亿元。门槛的提升反映了整个中国医药工业正在稳步前进。
突破100亿元大关的企业数量标志着医药行业的集中度。此次榜单中主营业务收入超过100亿元的大型企业数量已增至19家，相比2015年的16家增长3家。主营业务收入在30亿-100亿元之间的企业有56家，同比增加2家；主营业务收入30亿元以下有25家，同比减少5家。
本届百强企业累计实现医药工业主营业务收入6809亿元，同比增长11.1%，较我国医药工业平均水平（9.9%）高1.2个百分点。在国家“十三五”规划要求深化供给侧改革、提升产业集中度的宏观发展战略下，百强企业集中趋势明显，强者恒强的格局已经形成。
2016年对医药工业企业来说是动荡和不平静的一年。在两票制、仿制药一致性评价、临床数据核查等一系列政策改革下，企业面临大淘沙。同时国际化步伐、研发投入、并购重组、营销变革等都是影响百强企业激烈排位赛的核心因素。
国际化步伐在加快。2016年，百强企业中获得美国ANDA文号的数量为8个，分别为齐鲁制药（5个）、浙江海正（2个）、石药集团（1个），超过2015年的3个ANDA批文。
研发驱动日趋显著。2016年度研发投入前三强的企业正大天晴、浙江海正、江苏恒瑞均为历年高研发投入型企业，研发投入均超过10%。齐鲁制药凭借大力推进创新驱动战略成功提升一个位次，其肺癌治疗药物“伊瑞可”的成功上市打破了国外制药巨头在中国的垄断格局。
并购重组更有利于资源整合，强者恒强。华润医药在并购重组上一直保持旺盛的活力。2016年，华润三九以18.9亿元完成对圣火药业的收购，其王牌产品血塞通软胶囊有望成为超10亿的大品种。仁和集团先后收购药房网和多家地方连锁药房，2016年增速突破20%，百强榜排名提升15位。
营销变革有利于企业在复杂的医药市场格局中突围。2016年医药工业百强企业中有近20家（或其子公司）同时也是医药商业百强企业，如国药控股、华润医药和上海医药。在“两票制”的压力下，靠传统的多级代理销售的工业企业正在经历阵痛期，而有强大的自营体系的企业则能够有效地避开“两票制”带来的压力。
互联网思维也在重塑着企业营销格局。如康美药业采用独创的中药组方销售、终端体验营销、体质养生等方式大大拉动了医药健康消费；广药白云山下属企业与超过90家广东医疗机构开展了医院服务延伸项目合作，积极推进营销物流一体化。
会议同期发布了2017年中国医药研发产品线最佳工业企业、2017年中国医药工业最具投资价值企业（非上市）、2017年中国医药工业最具成长力企业。
中国医药工业百强企业是以反映国家医药工业经济运行状况的官方资料《中国医药统计年报》为依托，在工业企业法人单位基础上，由医药工业主营业务收入排序在前100位的企业构成。
该榜单历来是被各地药招办认可的“工信部医药工业排名”，在多个省市招标中，可以得到相应的加分。所有入围的百强企业全部出具了企业法人营业执照、具有法律效力的能够证明其医药工业部分数据的审计报告，以及本年度企业纳税申报表，以此作为审核认定的依据。
