习惯性流产的原因特别复杂，临床上把这些习惯性流产的原因归为6大类。
1.遗传因素。检查有问题的胚胎时发现，有60%是遗传物质出现了问题。
2.免疫排斥因素。怀孕是一个复杂的免疫过程，类似于两次器官移植，卵子从卵巢移到子宫，精子从另外一个人身上移到子宫，一次是自体移植，一次是异体移植。
说到器官移植，大家都会想到免疫排斥，怀孕以后也会有免疫排斥。
但是，母体会产生保护胎儿的封闭因子，或称保护因子，这样孩子才能在母亲体内生存10个月。但有很多习惯性流产的妇女体内免疫系统是紊乱的，该保护的没保护，不该排斥的排斥，就会导致自然流产的一再发生。
3.血液高凝状态。从怀孕8周开始，胎儿的血液循环和母亲的血液循环就能建立起血液流动。但有时候绒毛有一些微血栓，或者胎盘有一些微血栓，容易出现梗阻，就会导致胎停育。
4.病原微生物感染。母亲怀孕的时候感染病毒、细菌、原虫等，如支原体、衣原体、单纯疱疹病毒、链球菌、细小病毒等，这些通过生殖道上行扩散到宫腔，之后便会造成羊膜感染，羊膜就会变得很脆，进而破裂，导致流产。
5.内分泌因素。怀孕以后体内的内分泌会发生改变，异常的改变可能会影响胚胎的发育，如甲状腺功能异常、高血糖等，很可能会导致自然流产。
6.生殖因素。女性子宫内膜受损后，容易发生子宫内膜变薄、宫腔粘连、子宫内膜息肉、子宫肌瘤、宫颈管机能不全等，这些都会导致自然流产的发生。此外，卵子或精子质量不好，也会引起胚胎中途被淘汰掉。
第一次出现自然流产后，一定要重视，要找到什么原因，因为流产次数越多，再次妊娠失败的概率就越高。不过不用紧张，找到原因以后，医生会进行针对性的治疗。
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