疫苗中除了含有减毒活的或灭活的病毒、病毒蛋白、细菌毒素或细菌多糖等抗原成分外，还可能含有一些其他的物质，如佐剂、防腐剂、稳定剂、残留物等。
一、抗原
抗原是疫苗中最主要的有效活性组分。
疫苗中的抗原成分进入人体后，能够有效刺激机体的免疫系统发生特异性反应，包括体液免疫和（或）细胞免疫，产生保护性抗体或致敏淋巴细胞。
二、佐剂
佐剂是在疫苗制剂中加入的能够增加疫苗抗原性的物质。佐剂能增强抗原的特异性免疫应答和疫苗的黏膜传递，增强免疫接触和抗原的免疫原性等。
最常见的疫苗佐剂是铝佐剂。铝佐剂也是引起局部反应（红肿、硬结等）的主要原因。
三、防腐剂
防腐剂是指向疫苗中加入的用以防止疫苗使用中可能会污染疫苗并造成危害的细菌或真菌生长的物质。如硫柳汞、氯仿等。
由于添加剂量比较低，一般情况下防腐剂不会引起人体的不良反应。
四、稳定剂
稳定剂是保护疫苗抵御生产、储存过程中可能遇到的不良环境条件（如冷冻或高热）的物质。常见的有糖类（如蔗糖、乳糖），氨基酸类（如甘氨酸、谷氨酸钠），蛋白类（如明胶或人血白蛋白）。
五、残留物
一般来说，疫苗生产过程中用到的任何物质都可能出现在成品疫苗制剂中，这些来源于生产过程中的物质称为残留物。许多残留物可在生产过程中去除或减少其含量。
1、灭活物质残留：灭活物质是生产疫苗过程中用于消除病原体毒力，但保持其抗原性的物质。甲醛是最常见的灭活物质，广泛用于细菌和病毒疫苗的制备。
2、抗生素：抗生素是用来防止疫苗生产过程中被细菌污染的。常见易引起过敏反应的抗生素如青霉素类、头孢菌素类以及磺胺类药物都未用于疫苗中。常用于疫苗生产的抗生素主要有新霉素、链霉素、多粘菌素B 、金霉素、两性霉素B等。
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