对于单一药物可有效治疗的感染，不需联合用药，仅在下列指征时，可以考虑联合用药。
1 ）原菌尚未查明的严重感染，包括免疫缺陷者的严重感染。如根据临床表现最可能为细菌所引起，而病情危重不宜等待时，可送检有关标本进行病原检查后即予以抗菌药物联合治疗，选用的药物抗菌谱宜广，应能覆盖可能的病原菌。以后根据治疗后反应、病原检查及药敏试验结果进行调整。
2 ）单一抗菌药物不能控制的需氧菌及厌氧菌混合感染，2 种或2 种以上病原菌感染。
3 ）单一抗菌药物不能有效控制的严重感染，如感染性心内膜炎或败血症等重症感染。
4 ）需长程治疗，但长期用药可能产生耐药性者，如结核病、深部真菌病。
5 ）其他：治疗隐球菌脑膜炎应联合应用两性霉素B 与氟胞嗜咙，两性霉素B 的剂量应适当减少以减轻其毒性反应。
由于药物协同抗菌作用，联合用药时应将毒性大的抗菌药物剂量减少；联合用药时宜选用具有协同或相加抗菌作用的药物联合，如青霉素类、头抱菌素类等其他β内酞胺类与氨基糖昔类联合。
联合用药通常采用2 种药物联合，3 种及3 种以上药物联合仅适用于个别情况，如结核病的治疗。此外必须注意联合用药后药物不良反应将增多。
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