12月15-16日易贸医疗在上海举办的为期两天的基因检测与生信分析workshop圆满落幕,3位导师倾情分享,30位学员积极讨论,一场生信业内的深度交流温暖了寒冬。
12月15日上午
来自思路迪的精准诊断治疗研发副总裁李福根博士是本次活动的第一位导师,详细解释生物信息学是如何加速NGS产品开发的。对于NGS产品而言,目前没有产品开发的标准要求。而随着最近批准了4种NGS产品,NMP制定了针对含有有限突变基因数量的小panel产品的一般准则。然而,对于大panel而言,尽管已经有大panel获得了FDA的批准,但目前仍无可遵循的准则。不过,CAP具有来自实验室自验产品(LDT)的一般开发要求,而这可以做为开发大型panel的指导方针。一个半小时的分享结束后,大家踊跃提出问题,李博耐心解答。
李福根博士的精彩分享与学员的积极提问
12月15日下午
来自诺禾致源的副总经理田仕林先生为大家带来推进产业化内容,介绍了NGS智能化平台。该平台实现了业务精细管理,智能判断业务环节的流转,实时核算业务成本,自动化数据分析流程,缩短业务交付周期,同时实现海量数据管理,合理调配计算资源并提升计算资源利用率。建设智能化的业务管理平台,推动NGS产业快速发展。
田仕林先生的精彩分享与学员的积极提问
短暂的休息后进入嘉宾访谈环节,共同展望AI 的应用。嘉宾访谈主要是从4个方向共同探讨:
1.在基因测序产业发展中,大数据和人工智能技术应用机遇和挑战
2.讨论:当前基因测序AI技术的实际应用,产生的效益以及存在的瓶颈
3.人工智能技术如何能促进基因测序产品化,产业化,提升企业竞争力
4.讨论:针对AI技术的引进,基因测序公司将要做好准备,提前做好技术储备,人员储备
嘉宾访谈:展望未来,AI的应用
12月16日上午
第二天的上午来自海普洛斯的联合创始人&CTO陈实富博士为大家分享了开源软件开发实践。未来,生物信息学的工作将走向两个方向,一个方向是更多的贴近研究本源,去探索学术问题相关的生物信息学问题,另一个方向则是靠近IT技术,去设计生物信息学算法和开发生物信息学软件。陈博毫无保留地为大家分享了个人经历,鼓励大家勇于实践,终身学习。
陈实富博士的精彩分享与学员积极提问
12月16日下午
为了解决大家实际遇到的瓶颈问题,在活动前小易收集了部分学员的case,在现场大家就这些case热烈讨论、共同设计解决方案并展示。除了导师的指导与点评,各组间也互相给出建议,促进了彼此的交流,真正实现了共建行业工作圈。
case讨论如火如荼
至此,2018基因检测与生信分析Workshop圆满结束。易贸医疗衷心感谢3位导师的精彩分享以及与会嘉宾的参与,你们的支持与关注是我们前进的动力。
workshop大彩蛋
在最后的最后,附上陈实富导师的一首《如何开发一个好的开源生信项目》打油诗,献给所有对这方面感兴趣的小伙伴。
现实需求寻痛点,开源世界先调研
选好方向定路线,根据目标选语言
算法纸上先推演,复杂逻辑步步检
异常处理顾多边,测试代码要优先
输入清晰接口简,输出可解又可见
完善文档装门面,优化性能推体验
反馈回复勿隔天,新版叠出保新鲜
推广成果莫腼腆,发表论文证真坚