高通量挑选是药物产品研发十分基本的一步,但填满了局限,例如仅根据细胞生存状况、细胞样子更改解析来判断被筛化合物是不是最该进一步科学研究。这类粗略地的监测一般忽视了彼此之间的基因表达或细胞情况的转变,限定了学术研究对备选药物功效体制、异质性反映等信息内容的深层次掌握。 12月5日,最新消息发布在Science杂志期刊上名为“Massively multiplex chemical transcriptomics at single cell resolution”的一项科学研究中,来源于华盛顿大学等组织的专家叙述了一种名叫sci-Plex的新技术应用,该技术性融合了细胞核标记技术的改善及其单细胞基因表达解析的发展,可解析和定量分析没有响应不计其数种不一样化合物的单细胞的基因表达,掌握单独细胞在遭受不一样化合物功效时候产生哪些,表明药物对细胞起着的功效。 sci-Plex体制:Cells corresponding to different perturbations are lysed in-well, their nuclei labeled with well specific “hash” oligos, followed by fixation, pooling and sci-RNA-seq.(图片来源:Science) 定义认证科学研究中,科学研究工作人员利用sci-Plex开展了一次挑选:用180种被用以治疗肿瘤、HIV或本身免疫力病症的化合物解决三种不一样的癌证细胞系(败血症、肝癌和宫颈癌)。 在这其中一个试验中,专家共测量了来源于5000好几个单独被解决的样版的约65万只单细胞的基因表达(转录组)。数据显示,一些癌细胞对特殊的化合物的反映方法存有明显差别。 sci-Plex使在单独试验中对不计其数有机化学影响开展全转录组解析变成了将会(图片来源:Science) “2019年稍早,人们只有保持在单独试验中解析来源于偏少不一样样版的数以百万计的细胞。而如今,拥有sci-Plex,人们能够解析来源于不计其数不一样样版的数百万个细胞。它是振奋人心的发展。”领导干部该科学研究的Cole Trapnell博士研究生说。 HDAC抑制剂共享资源了转录反映(图片来源:Science) 学术研究们还利用sci-Plex对一类抗癌新药——HDAC抑制剂的功效方式开展了更深层次的科学研究。結果发觉,癌细胞遗传基因管控的转变与这种抑制剂根据阻隔动能来源于来阻拦癌细胞繁衍的功效原理相符合。 除此之外,该科学研究还确认,利用sci-Plex得到的细胞基因表达谱还可表明药物的法律效力。随之使用量的提升,学术研究们可观查到细胞对药物没有响应的稳定提高。 小结而言,专家觉得,依靠sci-Plex可得到细胞没有响应的全局性主视图,搞清备选药物的功效体制将十分有效。 Trapnell博士研究生坚信,sci-Plex将会会变成精准医学的有效专用工具。“以防癌而言,人们最后是期待杀掉全部恶性肿瘤,全部恶性肿瘤细胞,因而,了解不一样细胞对药物的不一样没有响应针对设计方案可‘痊愈’癌证的治疗法尤为重要。”她说。 总结行业:药物产品研发杂志期刊:Science闪光点:1)来源于华盛顿大学等组织的专家开发设计了一种名叫sci-Plex的药物挑选新技术应用,该技术性可解析和定量分析没有响应不计其数种不一样化合物的单细胞的基因表达,掌握单独细胞在遭受不一样化合物功效时候产生哪些,表明药物对细胞起着的功效;2)利用sci-Plex得到的细胞基因表达谱还可表明药物的法律效力;3)该科学研究的管理者觉得,sci-Plex将会有利于创建不一样细胞没有响应药物干涉的全方位图普,变成精准医学的有效专用工具。有关毕业论文:[1] Sanjay R Srivatsan et al. Massively multiplex chemical transcriptomics at single cell resolution. Science(2019). 参考文献:1# Technique shows how individual cancer cells react to drugs(来源于: University of Washington Health Sciences/UW Medicine)2# Drug Discovery Gains Powerful Single Cell Transcriptional Profiling Tool(来源于:GEN)新靶点NKG2A | GARP | CD22 | LIF | CDK2 | WWP1 | VCAM1 | Flower | CD24 | Gingipains | DES1 | GPR139 | DHX37 | CXCL10-CXCR3轴 | 628个靶点 | CA19-9 | PTPN2疗法 双非特异抗原 | PROTACs技术性 | 第四代EGFR抑制剂 | RNAi药物 | GCGR抗原 | AMPK激动剂 | 奇妙胶襄| CAR-T治疗法 | 降低胆固醇药物 | 阳光照射+响声 | 调整新陈代谢 | 基因疗法 | 天生免疫力 | 细胞医治 | 智能化i-甘精胰岛素 | 胚胎干细胞 | 河豚毒素 | 流感病毒 | 肠胃病菌 | 恶性肿瘤预苗 | 溶瘤病毒感染 | hiv病毒预苗 | IL-12 | 纳米技术颗粒物 | 口服胰岛素 | PARP抑制剂 | ADC药物 | KRAS抑制剂新机制 PD-1抗原与肠菌 | 病菌与癌证 | CCR5与脑中风康复治疗 | 糖推动恶性肿瘤 | 金子钾 | PD-1加快恶性肿瘤生长发育 | 癌细胞神密偷渡PD-L1 | 宫颈癌抗药性 | 铁身亡 | PARP抑制剂 | 哮喘病鼻窦炎谜团 | 致命性心肌梗塞 | TOX | 帕金森 | 肺癌转移 | 血压高 | 减肥产品 | 超级细菌毒力电源开关 | 輔助T细胞临床流行病学脑卒中康复 | 炎症性肠病 | 少年儿童癌证 | 淋巴肿瘤和骨髓瘤 | 直肠癌 | 多发性硬化 | 我国前十大死亡原因 | 血压高 | 全世界癌证地形图照亮“在看”,好文章相随Science:新药研究攻克技术性——sci-Plex!