用透明度判断肥水是最粗略的做法，有条件的小水库和库湾应采水测定肥水的指标，以决定施放何种肥更为适宜。
肥水指标是有机物耗氧量（COD），为15~25毫克/升。
溶解无机氮为0.5~1.2毫克/升；
溶解无机磷0.05~0.1毫克/升；
溶解氧（DO）午夜和凌晨始终保持在3毫克/升以上，一日间其他时间应在5毫克/升以上；
浮游植物的生物量（湿重）起点为20毫克/升；浮游动物的生物量的起点为5毫克/升。
肉眼观察水色时，肥水水色应是油绿色或淡褐绿色。浮游植物优势种群以硅藻、隐藻或金藻为主，浮游动物以轮虫、枝角类为主。
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